Бернхард Симон родился 29 февраля 1816 года в небольшом городке немецкой горной Швейцарии Нидерурнэн (Кантон Гларус) в семье сапожника и фермера Бальтазара Симона и его жены Катарины.

С 1835 по 1839 жил во французской Швейцарии ‒ в Лозанне у родного дяди Фридолина Симона (1790‒1850 гг.), под началом которого в течение трёх лет учился, получив первые профессиональные навыки. По окончании обучения он стал помогать дяде в ведении строительных работ, а также выполнил собственный проект пастората (дома пастора). Симон тогда же проявил себя и как подающий надежды автор инженерных сооружений, восстановив, построенный по проекту кантониального инженера мост в муниципалитете Бельмонт.